2025版《中国药典》解读 | “分子学解码”系列第一期

分子学解码·开篇

药典四部的修订与新增概览

2025版中国药典自2025年10月1日起实行。以下是对与分子学方法相关的药典四部发生的主要变化（修订、新增）进行的汇总：

PART 1通则部分

0200 其他通则

0212

药材和饮片检定通则（修订）

聚合酶链式反应鉴别法是通过比较药材、饮片的DNA 差异来鉴别药材、饮片的方法。

分子学产品方案：qPCR

0251

药用辅料（修订）

生产药品所用的辅料必须符合药用要求，药用辅料的微生物限度应符合要求；用于无除菌工艺的无菌制剂的药用辅料应符合无菌要求（通则 1101）。

分子学产品方案：qPCR、dPCR

0261

制药用水（新增）

增加微生物检测（包括纯化水和注射用水）内容，给出的方法为培养法，但是提到也可以采用经充分验证的更优方法来进行微生物监测

分子学产品方案：qPCR 快检、dPCR

1000 分子生物学检查法

1001

聚合酶链式反应法（单独修订）

增加对第二法“实时荧光定量 PCR 法”的具体描述，包括仪器、试剂的一般要求、测定方法、方法验证要求等

分子学产品方案：qPCR

1021

细菌 DNA 特征序列鉴定法（修订）

一代 sanger 测序 16S 进行细菌鉴定的方法，对于利用16S rRNA 基因特征核酸序列无法准确区分鉴定的一些近源菌种，也可结合其他经过验证的基因特征序列或全基因组序列进行分子生物学鉴定。

分子学产品方案：毛细管电泳（CE）基因分析仪、NGS

3400 生物测定法

3430

细胞种属鉴别法（新增）

确保生物制品生产用细胞基质种属来源正确，防止交叉污染，旨在解决传统细胞鉴别方法（如染色体核型、同工酶分析）的局限性，提供更精准、高效的分子生物学技术标准。增加了 PCR 法琼脂糖电泳和 DNA 条形码法。

分子学产品方案：增加多重 PCR 法和 DNA 条形码法（CE）

PART 2指导原则部分

9000 指导原则

9094

分析仪器确证指导原则（新增）

旨在规范分析仪器的全生命周期管理，填补药典在仪器确证标准化方面的空白，全生命周期管理框架 4Q 包括 DQ、IQ、OQ、PQ；并将设备进行风险等级管理，分别是：A 类(低风险)、B 类(中风险)、C 类(高风险)。

分子学产品方案：qPCR、CE、dPCR、NGS 的IQ、OQ、PQ 和 CSV 等合规服务要求。

9110

微生物全基因组测序技术指导原则（新增）

微生物全基因组测序（Microbial whole-genome sequencing）是指利用高通量测序技术对微生物个体的整个基因组序列进行测定，获取遗传信息的过程。高通量测序技术主要包括：边合成边测序、半导体测序、DNA（Deoxyribonucleic acid, DNA）纳米球测序、连接酶测序等第二代测序技术（又称下一代测序，Next Generation Sequencing）和基于单分子测序（Single Molecule Sequencing）的第三代测序技术。强调保证测序通量充足和测序数据充分覆盖待测微生物基因组。

分子学产品方案：NGS 等

9201

药品微生物检验替代方法验证指导原则（修订）

相较于传统方法，新技术通常具有快速、可实现实时或近实时监控等优势。这些新技术大体可分为三类：第三类③分析微生物细胞中特定成分的技术，如脂肪酸测定技术、核酸扩增技术、基因指纹分析技术等。

定性试验就是测定样品中是否存在活的微生物，如无菌检查及控制菌检查；鉴定试验就是借助现有的分类系统，通过对未知微生物的特征测定，对其进行细菌、酵母菌和霉菌大类的区分，或属、种及菌株水平确认。鉴定试验的验证参见微生物鉴定指导原则（通则 9204）。

分子学产品方案：CE，qPCR 无菌快检，dPCR，NGS

9203

药品微生物实验室质量管理指导原则（修订）

必要时，微生物实验室应开展微生物检测的测量不确定度评定；也应按质量风险管理要求开展风险评估，为微生物可能导致的质量问题提供有效信息与分析。 菌种必须定期转种传代，并做纯度、特性等实验室所需关键指标的确认，实验室应建立菌种管理（从标准菌株到工作菌株）的文件和记录，内容包括菌株的申购、进出、收集、贮藏、确认、转种、使用以及销毁等全过程。

分子学产品方案：CE，qPCR，dPCR，NGS

9204

微生物鉴定指导原则（修订）

系统发育典型的分析方法通过比较细菌 16S rRNA 基因，真菌 18S rRNA 基因、ITS 区域核酸序列来实现，即经过PCR基因扩增、电泳分离扩增产物核酸测序，然后与经验证的专业数据库或利用公共数据库进行比对鉴定分析。

菌株分型通常需在菌种鉴定基础上开展。常见的菌株分型方法包含限制性核酸内切酶 Southern 杂交方法、脉冲场凝胶电泳方法、多位点序列分型、全基因组测序方法等。

分子学产品方案：CE，NGS

9205

药品洁净实验室微生物监测和控制指导原则（修订）

定期监测内容项目包括物理参数、非生物活性的空气悬浮粒子数和有生物活性的微生物，其中微生物监测包括环境浮游菌和沉降菌监测，及关键的检测台面、人员操作服表面及 5 指手套等的微生物检测。微生物检测方法为培养法，微生物鉴定参考 9204。

分子学产品方案：CE，NGS

9209

制药用水微生物监测和控制指导原则（新增）

指导原则内容包括三个部分：

（１）制药用水中微生物的特点，从微生物来源、类群、生物膜、细菌内毒素四个方面分析制药用水系统中污染微生物的特殊性和潜在风险；（２）微生物监测（9201），阐述微生物检验的意义和局限性，明确检验方法选择、调整的基本要求，指导监测方案和标准的制定，并推荐可使用快速微生物检验方法；

（３）微生物控制和风险提示，从制药用水全生命周期分析和提示微生物控制要点。

分子学产品方案：CE，qPCR 无菌快检，dPCR，NGS

9212

非无菌产品不可接受微生物风险控制指导原则（新增）

参考 9204 进行微生物鉴定

分子学产品方案：CE，NGS

PART 3分子学方案

Applied Biosystems™ 7500 

实时荧光定量 PCR 系统

Applied Biosystems™QuantStudio™5

实时荧光定量 PCR 系统

Applied Biosystems™QuantStudio™ 6/7 Pro 

实时荧光定量 PCR 系统

Applied Biosystems™ QuantStudio™ 6/7 Flex实时荧光定量 PCR 系统

Applied Biosystems™ 

QuantStudio™Absolute Q™数字PCR系统

Applied Biosystems™ 3500 基因分析仪

Applied Biosystems™ SeqStudio 基因分析仪

Applied Biosystems™ SeqStudio Flex

系列基因分析仪

 Ion GeneStudio™ S5 系列高通量测序系统

Ion GeneStudio™ Genexus

一体化高通量测序系统

尾声

后续我们将对整个药典第四部与分子学相关的内容进行解析，欢迎大家继续关注！